Insights from paleomicrobiology into the indigenous peoples of pre-colonial America - A Review

This review investigates ancient infectious diseases in the Americas dated to the pre-colonial period and considers what these findings can tell us about the history of the indigenous peoples of the Americas. It gives an overview, but focuses on four microbial pathogens from this period: Helicobacter pylori, Mycobacterium tuberculosis, Trypanosoma cruzi and Coccidioides immitis, which cause stomach ulceration and gastric cancer, tuberculosis, Chagas disease and valley fever, respectively. These pathogens were selected as H. pylori can give insight into ancient human migrations into the Americas, M. tuberculosis is associated with population density and urban development, T. cruzi can elucidate human living conditions and C. immitis can indicate agricultural development. A range of methods are used to diagnose infectious disease in ancient human remains, with DNA analysis by polymerase chain reaction one of the most reliable, provided strict precautions are taken against cross contamination. The review concludes with a brief summary of the changes that took place after European exploration and colonisation.

Coccidioidomycosis in armadillo hunters from the state of Ceará, Brazil

Coccidioidomycosis is a systemic mycosis with a variable clinical presentation. Misdiagnosis of coccidioidomycosis as bacterial pneumopathy leads to inappropriate prescription of antibiotics and delayed diagnosis. This report describes an outbreak among armadillo hunters in northeastern Brazil in which an initial diagnosis of bacterial pneumonia was later confirmed as coccidioidomycosis caused by Coccidioides posadasii. Thus, this mycosis should be considered as an alternative diagnosis in patients reporting symptoms of pneumonia, even if these symptoms are only presented for a short period, who are from areas considered endemic for this disease.

Coccidioidomicose pulmonar e extrapulmonar: três casos em zona endêmica no interior do Ceará / Pulmonary and extrapulmonary coccidioidomycosis: three cases in an endemic area in the state of Ceará, Brazil

A coccidioidomicose, uma doença fúngica adquirida através da inalação do agente Coccidioides sp. sob a forma de artroconídio, foi pela primeira vez descrita em 1894. Restringe-se principalmente a áreas de clima árido, solo alcalino e regiões de baixo índice pluviométrico. Não por acaso, a maioria dos casos descritos no Brasil ocorreu na região Nordeste. Relatam-se três casos de coccidioidomicose pulmonar ocorridos nos anos de 2005 e 2006, em zona endêmica no interior do Ceará. Todos eram homens imunocompetentes de idade adulta, adeptos à prática de caça a tatus (Dasypus novemcinctus) com queixas de tosse, febre, dispneia e dor pleurítica. Houve evoluções com comprometimento pulmonar e lesão cutânea foi observada em apenas um paciente. Todos apresentaram radiografia e TC de tórax com lesões características da coccidioidomicose. O diagnóstico foi confirmado através de teste sorológico. Todos evoluíram para cura após tratamento com antifúngico.

Coccidioidomycosis, a fungal illness acquired by the inhalation of arthroconidia of Coccidioides sp., was first described in 1894. Coccidioidomycosis is mainly restricted to areas with arid climate, alkaline soil and low rainfall. Consequently, most of the reported cases in Brazil have occurred in the northeastern region. We report three cases of pulmonary coccidioidomycosis occurring between 2005 and 2006 in an endemic area in the state of Ceará, Brazil. The three patients were immunocompetent adult males, hunters of armadillos (Dasypus novemcinctus), with complaints of cough, fever, dyspnea and pleuritic pain. All three patients presented pulmonary involvement, and only one also presented cutaneous lesions. Chest X-rays and CT scans of the patients revealed characteristic coccidioidomycosis lesions. The diagnosis was confirmed by serological testing. All of the patients evolved to cure after antifungal treatment.

Coccidioidomicosis extrapulmonar: Presentación de un caso y revisión de la literatura / Extrapulmonary coccidioidomycosis: Case report and review

La coccidioidomicosis es una micosis endémica en el sudoeste de los Estados Unidos, México y ciertas áreas de centro y Sudamérica. Los agentes causales son hongos del género Coccidioides. La infección primaria, habitualmente, involucra los pulmones, ocurriendo su diseminación en menos de 1 por ciento de los casos. Si bien la enfermedad extrapulmonar, usualmente, involucra la piel, el sistema nervioso central, los huesos y las articulaciones, tiene la capacidad de infectar cualquier órgano o tejido. Presentamos un caso de coccidioidomicosis extrapulmonar en un paciente masculino, con 20 años de edad, cuyo diagnóstico se estableció en una biopsia de ganglio linfático. La historia clínica no fue relevante y la biopsia se realizó debido a los hallazgos físicos sugerentes de linfoma.

Coccidioidomycosis is a deep mycotic infection endemic in the Southwestern part of the United States and Mexico and certain areas of Central and South America. The causative agents are fungi of the genus Coccidioides. Primary infection usually involves the lungs, and dissemination occurs in less than 1 percent of cases. While the extrapulmonary disease usually involves the skin, central nervous system, bones or joints, it can involve any tissue or organ. We present a case of extrapulmonary coccidioidomycosis in a 20-year-old male, in whom the diagnosis was made by a lymph node biopsy. His past history was not significant and the biopsy was performed because the physical findings were suggestive of lymphoma.

Isolamento e identificação de Coccidioides immitis de amostras de solo relacionadas a surtos de Coccidioidomicose / Isolation and identification of Coccidioides immitis from soil samples related to outbreaks of coccidioidomycosis

A coccidioidomicose (CM) é micose sistêmica endêmica no semi-árido do nordeste brasileiro causada pelo fungo dimórfico geofílico Coccidioides posadasii [=C.immitis (non-CA)].No Brasil a principal característica epidemiológica relacionada a surtos da CM aguda é o distúrbio ambiental provocado por caçadores de tatus que, ao desentocarem o animal de seu habitat natural, revolvem solo contaminado e se infectam ao inalar propágulos (artroconídios) do fungo dispersos na poeira do ar, desencadeando o processo de infecção e doença.O presente trabalho teve como objetivos(i)Isolar e identificar por metodologias clássicas agentes de micoses sistêmicas em amostras ambientais relacionadas a surtos de CM;(ii) Avaliar a eficiência de protocolos para extração de DNA a partir das amostras ambientais utilizando duas metodologias distintas:a)criofratura com nitrogênio líquido e b)kit de extração comercial Fast DNA® SPIN® Kit For Soil Q-BIOgene;(iii)Desenvolver iniciadores específicos para a detecção de C.posadasii utilizando recursos de bioinformática;(iv)Avaliar e validar os iniciadores específicos,utilizando-os na detecção de C. posadasii em DNAs de amostras de solo.Foram analisadas por estas metodologias amostras ambientais de dois sítios suspeitos de contaminação por C.posadasii.De 10 amostras de solo coletadas em Elesbão Veloso,3(30 por cento) foram positivas para C.posadasii por inoculação animal,2(20 por cento)foram positivas pela PCR direta e 10 (100 por cento) foram positivas no rastreamento com a técnica de PCR semi-nested. De 23 amostras de solo coletadas em Caridade do Piauí,3(13,3 por cento) foram positivas para C. posadasii por inoculação animal,6(42,8 por cento) de 14 amostras foram positivas pela PCR direta e todas estas 14 amostras (100 por cento) foram positivas no rastreamento com a PCR semi-nested. De 23 amostras de solo coletadas em Caridade do Piauí,3(13,3 por cento) foram positicas para C. immitis non-CA por inoculação animal,6 (42,8 por cento) de amostra...

Detección de infección por Coccidioides immitis en zonas del estado de Coahuila, México / Detection of Coccidioides immitis infection in Coahuila, Mexico

La coccidioidomicosis es una micosis inicialmente pulmonar causada por Coccidioides immitis; puede diseminarse principalmente a sistema nervioso central, huesos y piel. En México se desconoce la frecuencia exacta de esta enfermedad. Nuestro objetivo fue determinar, por intradermorreacción y por serología, los casos de infección por C. immitis en 12 comunidades (10 rurales y dos urbanas) atendidas en el Hospital Rural Nº 79 del Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS) del estado de Coahuila, México. Se estudiaron 668 individuos adultos de ambos sexos; se les aplicó 0,1 ml de coccidioidina por vía intradérmica; después de 72 hs. se midió el diámetro de induración. Fueron seleccionados 180 individuos y a partir del suero se determinaron los niveles de inmunoglobulinas anti-C. immitis por ELISA. Fueron positivos a la coccidioidina 621 sujetos (93%), frecuencia mucho mayor a la reportada previamente en Coahuila. De los 180 sueros estudiados los promedios de densidad óptica (DO) fueron: IgG1, 1,55; IgG2, 0,94; IgG total, 0,33; IgG3, 0,29; IgG4, 0,27; IgM, 0,08. Los valores de IgG1, IgG2 e IgM comparados con las otras inmunoglobulinas fueron estadísticamente significativos. Los valores de IgG1 e IgG2 sugieren contacto frecuente con los antígenos e incluso probables casos de enfermedad no diagnosticada.

Coccidioidomycosis is a mycosis firstly pulmonar caused by Coccidioides immitis; it can be disseminated to central nervous system, bones and skin, principaly. In Mexico, the real frequency of the disease is unknown. The aim of this work was to determine, by skin test and by serology, the infection cases by C. immitis in twelve communities (10 rural and two urban), attended in the Hospital Rural Nº 79 at the Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS) from the Coahuila State, Mexico. Six hundred and sixty eight adult individuals of both sexes were studied, to whom 0.1 ml of coccidioidin by intradermal route was applied; 72 h after, the induration diameter was measured. One hundred eighty individuals were selected and seric anti-C. immitis immunoglobulins levels were determined by ELISA. Six hundred twenty one individuals (93%) were positive to coccidioidin, the frequency was much higher than that previously reported in Coahuila. From 180 sera studied, the means of optical density (OD) were: IgG1, 1.55; IgG2, 0.94; total IgG, 0.33; IgG3, 0.29; IgG4, 0.27; IgM, 0.08. The values of IgG1, IgG2 and IgM compared with the other immunoglobulins were statistically significant. The high values of IgG1 and IgG2 suggest frequent contact with the antigen, and probable cases of undiagnosed disease.

Coccidioidomicose pulmonar em caçador de tatus / Pulmonary coccidioidomycosis in a armadillo hunter

A coccidioidomicose, uma doença fúngica adquirida através da inalação do agente Coccidioides immitis sob forma de artroconídio, vem sendo descrita desde 1892. Restringe-se principalmente a áreas de clima árido, solo alcalino e regiões de baixo índice pluviométrico. Não por acaso, a maioria dos casos descritos no Brasil ocorreu na região Nordeste. Relata-se o caso de um homem de 19 anos, imunocompetente, com queixa de dor pleural bilateral, febre, adinamia e tosse seca havia dois meses. A radiografia de tórax evidenciou múltiplos nódulos bilaterais. O paciente participava de caçadas a tatus (Dasypus novemcinctus) e a pesquisa direta para fungos no escarro evidenciou Coccidioides sp. Tratado com anfotericina B, apresentou pneumotórax e insuficiência respiratória, indo a óbito. A biópsia pulmonar post mortem evidenciou Coccidioides immitis sob a forma de endósporos

Coccidioides immitis: Infección primaria del sistema nervioso central. Informe de un caso y revisión de la literatura / Case report and literature review of primary coccidioidal meningitis

Se presenta un caso de meningitis primaria (sin afección pulmonar, ósea o dérmica) por el hongo Coccidioides immitis en un hombre de 27 años de edad que acudió por un síndrome de cráneo hipertensivo de un mes de evolución atendido en nuestra institución. El paciente provenía del norte de California y era previamente sano, sin antecedentes para sospechar inmunodeficiencia. La punción lumbar mostró glucosa 22 mg/dL, proteínas totales 62 mg/dL, leucocitos 110 células/mm3 97 por ciento polimorfonucleares, 3 por ciento mononucleares. La tomografía axial computada de cráneo evidenció dilatación ventricular bilateral. Se hizo el diagnóstico de meningitis por coccidioides immitis mediante la detección de anticuerpos (IgM 6.8 mg/dL e IgG 4.9 mg/dL; normal < 2 mg/dL) y cultivo de líquido cerebroespinal. La radiografía de tórax no mostró alteración alguna. La detección de anticuerpos contra el virus de la inmunodeficiencia humana fue negativa. Se colocó una válvula de derivación ventrículo-peritoneal y se manejó con anfotericina B intravenosa e intratecal a través de un reservorio de Ommaya. A pesar de este tratamiento, el paciente se deterioró neurológicamente y falleció dos semanas después de su egreso en su lugar de origen

Coccidioidomicose: novo caso brasileiro / Coccidioidomycosis: a new brazilian case

A case of pulmonary coccidioidomycosis from the rural zone of Bertolinia, PI, is reported. The patient, a farm worker, attributed his illness to the dust inhaled while digging a water well during the dry season of the year, some weeks before the onset of the clinical manifestations. The main symptoms of the disease were severe chest pain and moderate fever. The diagnosis was made histopathologically: tissue phase fungal organisms--immature spherules and spherules with endospores--were observed in histological sections of a lung fragment obtained by open chest biopsy. This is the twelfth autochthonous case of coccidioidomycosis found so far in Brazil. All of them involved native inhabitants of the semi-arid part of Northeastern Brazil. The hot and dry environment of the region seems to favor the development of C. immitis in the soil. Humans and animals probably acquire the infection by digging the soil, when they become exposed to the conidium-bearing dust raised by this activity.

É descrito um caso de coccidioidomicose pulmonar oriundo da zona rural de Bertolínia, PI. A manifestação clínica principal consistiu em dor torácica e o diagnóstico teve por base o achado do agente ¾ Coccidioides immitis ¾ em cortes histológicos. Formas teciduais do microrganismo ¾ esférulas imaturas e maduras ¾ estavam presentes nas lesões observadas em fragmento pulmonar removido do paciente por biópsia a céu aberto. Este novo caso autóctone da doença, como os outros anteriormente descritos no Brasil, procedia do interior semi-árido da Região Nordeste. O ambiente quente e seco do sertão nordestino oferece, sem dúvida, condições propícias ao desenvolvimento de C. immitis, um habitante do solo. As pessoas e animais do local devem adquirir a infecção ao revolver a terra, ato que os expõe à poeira contendo os propágulos do fungo.

Virulence factors in fungi of systemic mycoses

Fungos patogênicos causadores de micoses sistemicas possuem vários fatores que permitem seu crescimento nas condiçöes adversas oferecidas pelo hospedeiro, propiciando o estabelecimento da relaçäo parasitária e contribuindo no processo de doença. Esses fatores säo conhecidos como fatores de virulencia auxiliando no desenvolvimento da infecçäo e interferindo com a patogenese das micoses. O presente trabalho avalia os fatores de virulencia em fungos patogenicos como Blastomyces dermatitis, Coccidioides immitis, Cryptococcus neoformans, Histoplasma capsulatum e Paracoccidioides brasiliensis, em relaçäo a termotolerancia, dimorfismo, componentes da parede celular ou capsula, bem como a producao de enzimas...

Coccidioidomycosis in Brazil: a case report

Coccidioidomicose e infecçäo endemica com distribuiçäo geográfica relativamente limitada: Mexico, Guatemala, Honduras, Colombia, Venezuela, Bolivia, Paraguai, Argentina e Sudeste dos Estados Unidos. Nestes paises, a area endemica esta restrita a regiöes deserticas ou semiaridas, semelhantes as do Nordeste do Brasil. Registro do caso: paciente masculino de 32 anos, nascido no Estado da Bahia (Nordeste do Estado), vivendo ha seis anos em Säo Paulo (Sudeste). Foi admitido no Departamento de Pneumologia do Hospital das Clínicas em outubro de 1996, com historia de tosse produtiva e progressiva ha seis meses, febre, mal estar, calafrios, perda de peso, fraqueza e artralgia das pequenas articulaçöes...

Isolation of human fungi from soil and identification of two endemic areas of Cryptococcus neoformans and Coccidioides immitis

Se presenta un estudio de endemia de micosis causadas por hongos patogenos primarios en dos zonas de la Provincia de Cordoba, Argentina, donde previamente se diagnostico un caso clinico de criptococosis pulmonar en una de las areas (Alta Gracia) y se encontraron altos indices de infección para C. immitis y C. neoforms en la problación de la segunda zona (Villa Dolores). En ambas regiones se encontraron hongos patogenos en suelos; en Villa Dolores se pudo aislar C. immitis en 2/40 muestras de tierra y en 1/40 muestras de C. neoformans. Mientras que en la Cuidad de Alta Gracia se pudo aislar C. neofrormans en 2/25 muestras de tierra. El indice de infección de la población con coccidioidina, en Villa dolores, fue de 33,8% y con criptococcina de 31.9%. Tambien se determino el indice de infección de la población con criptococcina en alta Gracia, el cual fue del 5.3%

Coccidioidomicosis pulmonar crónica progresiva en una paciente con diabetes mellitus tipo II / Chronic progressive pulmonary coccidioisis in a patient with type II diabetes mellitus

Se informa una paciente con diabetes mellitus tipo II y coccidioidomicosis pulmonar crónica progresiva. Esta paciente recibió tratamiento para tuberculosis pulmonar durante 2 años, a pesar de la persistencia de la sintomatología y la evolución de las lesiones. La citología exfoliativa del esputo, teñida con Papanicolaou mostró la presencia de endosporas las cuales se confirmaron con las ticiones de PAS y Grocott, asimismo el cultivo en Sabouraud desarrolló C. immítis. Siendo Nuevo León una zona endémica de coccidioidomicosis, es necesario considerar esta posibilidad en todo paciente con lesiones radiográficas pulmonares. Asimismo, debido a la facilidad de su transformación aérea, debe considerarse esta posibilidad e investigarla en los pacientes con antecedente de estancia o visita a las zonas endémicas localizadas en la franja fronteriza México-Estados Unidos